Częściej spotykane rodzaje filtrów wewnętrznych podaje. Filtry wewnętrzne należy okresowo (co najmniej raz na dwa tygodnie) czyścić. Długo nie czyszczone mogą być źródłem zanieczyszczeń wody. Czyszczenie filtrów polega na wyjęciu materiału filtracyjnego oraz jego dokładnym wypłukaniu. Naczynia, pojemniki i rurki należy przemyć dużą ilością bieżącej wody. Lepsze, ze względu na większą ilość materiału filtracyjnego oraz możliwość umieszczenia rozmaitych specjalnych warstw substancji pochłaniających, są filtry zewnętrzne. Filtr zewnętrzny zbudowany jest ze zbiornika wypełnionego warstwami materiałów filtracyjnych, studzienki, z której przefiltrowaną wodę powietrze przepompowuje do akwarium oraz rurki, którą na zasadzie naczyń połączonych stale napływa woda z akwarium. Zwykle stosuje się trzy warstwy filtracyjne: górną i dolną z tworzyw, używanych w filtrze wewnętrznym. Jako warstwę środkową używa się: żwiru lub węgla aktywowanego, rzadziej wymieniacza jonowego bądź torfu.
Najbardziej celowe jest stosowanie dość drobnoziarnistego żwiru lub specjalnie przygotowanego do celów akwarystyki węgla aktywowanego, przy czym użycie tego ostatniego oprócz zalety usuwania szkodliwych substancji ma tę wadę, że zabiera z wody również substancje odżywcze potrzebne roślinom. Stałe stosowanie zmiękczaczy, jako warstwy filtracyjnej w celu powolnego zmiękczania wody, nie jest wskazane, gdyż długotrwałe działanie wody może spowodować wypłukanie z nich pewnych szkodliwych związków. Ponadto filtr taki wymaga częstej regeneracji. Długotrwałe używanie torfu polecamy tylko wtedy, gdy chcemy mieć wodę kwaśną i o dużej ilości garbników (np. przy hodowli ryby akwariowe razbory klinowej Rasbora heteromorpha).
Najbardziej celowe jest stosowanie dość drobnoziarnistego żwiru lub specjalnie przygotowanego do celów akwarystyki węgla aktywowanego, przy czym użycie tego ostatniego oprócz zalety usuwania szkodliwych substancji ma tę wadę, że zabiera z wody również substancje odżywcze potrzebne roślinom. Stałe stosowanie zmiękczaczy, jako warstwy filtracyjnej w celu powolnego zmiękczania wody, nie jest wskazane, gdyż długotrwałe działanie wody może spowodować wypłukanie z nich pewnych szkodliwych związków. Ponadto filtr taki wymaga częstej regeneracji. Długotrwałe używanie torfu polecamy tylko wtedy, gdy chcemy mieć wodę kwaśną i o dużej ilości garbników (np. przy hodowli ryby akwariowe razbory klinowej Rasbora heteromorpha).
